Hal-hal yang menjadi langka akibat penggunaan pupuk kimia dan pestisida

Bakteri Pseudomonas Fluorescens dilaporkan bisa menekan pertumbuhan patogen dalam tanah secara alamiah,
dengan genus Agrobacterium, Bacillus, dan Pseudomonas menjadi langka akibat pupuk kimia dan pestisida.
Bakteri-bakteri penghasil antibiotik mempengaruhi tanah dengan hasil metabolit seperti antibiotik terikat pada tanah liat dan bahan organik tanah, atau terurai dengan cepat oleh mikroflora menjadi langka akibat pupuk kimia dan pestisida.
Bakteri-bakteri sebagai agen penghasil siderofor berupa senyawa organik selain antibiotik yang dapat berperan dalam
pengendalian hayati penyakit tumbuhan yang mempunyai affinitas kuat terhadap besi (III). dan berperan aktif dalam menekan pertumbuhan mikroorganisme patogen (Fravel 1988) menjadi langka akibat pupuk kimia dan pestisida.